Era nato il 15 marzo 1841 a S. Lorenzo di Trevi, in Umbria, figlio di Sebastiano Bonilli e Maria Allegretti. Fece gli studi per il presbiterato e fu ordinato nel 1863, dopo essere già stato nominato parroco nel piccolo e poverissimo villaggio di Cannaiola, dove sarebbe poi rimasto per trentadue anni.
Prese a modello, per la spiritualità di una comunità collocata in un piccolo paese, la Sacra Famiglia di Nazareth. Rinnovò dalle fondamenta la vita religiosa della parrocchia e gradualmente diffuse in tutta Italia la sua dottrina mediante la predicazione, l'organizzazione, l'attività editoriale.
Nel 1884, al fine di prendersi cura dei ragazzi abbandonati della regione, avviò a Cannaiola l'opera del "Piccolo orfanotrofio di Nazareth", che nel 1887 divenne orfanotrofio per ragazze. Affidò a un gruppo di donne la cura delle orfanelle, e l'anno seguente fondò l'Istituto delle Suore della Sacra Famiglia, che rapidamente si diffuse in molte diocesi italiane.
Nel 1893 aprì un ospizio per bambini ciechi, sordi e muti, affidando l'amministrazione alle suore dell'Istituto. Esso fu poi trasferito a Spoleto, una sorte seguita dallo stesso Pietro, che fu in qualche modo consolato dal distacco dai suoi amati parrocchiani con la nomina a canonico della cattedrale, poi a economo e infine a rettore del seminario arcivescovile, con responsabilità di supervisione pastorale di tutte le case religiose dell'archidiocesi. Fu assai richiesto come direttore spirituale; trascorreva molte ore in confessionale ed era noto per lo scrupolo con cui svolgeva il suo ministero.
Nel 1908 papa Pio X gli tributò un'onorificenza pontificia in riconoscimento dei molti servizi da lui resi alla Chiesa. Nonostante la salute malferma visse fino a età avanzata. Morì nelle prime ore del 5 gennaio 1935. Fu beatificato insieme ad altri tre candidati in piazza S. Pietro il 24 aprile 1988.
MARTIROLOGIO ROMANO. A Spoleto in Umbria, beato Pietro Bonilli, sacerdote, fondatore della Congregazione delle Suore della Sacra Famiglia per l’assistenza e l’educazione delle ragazze bisognose e orfane.
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