Non si sa niente della vita privata di Anatolio. Conosciuto come filosofo e matematico, condusse una scuola aristotelica ad Alessandria. A causa di una rivolta scoppiata a Bruchio, quartiere portuale della città, l'esercito romano l'assediò, probabilmente nel 263, provocando molte sofferenze per la mancanza totale di generi alimentari: la carestia e le malattie rischiarono di fare molte vittime innocenti.
Secondo la tradizione, Anatolio tuttavia persuase il generale romano a permettere al popolo di lasciare la città; i capi dei ribelli all'inizio rifiutarono, ma ancora una volta Anatolio usò il suo prestigio per salvare i civili.
Qualche tempo dopo, Anatolio si recò in Palestina, dove divenne vescovo coadiutore di Cesarea; in occasione del secondo concilio di Antiochia nel 268 si recò a Laodicea, in Siria, dove era vescovo Eusebio, suo amico. Alla morte di quest'ultimo, Anatolio fu prescelto per la successione; non si hanno informazioni sul suo episcopato. Morì nel 283 circa.
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